第二池的粪皮和粪渣的数量减少，因此发酵分解的程度较低，由于没有新粪便的进入，粪液处于比较静止状态，这有利于漂浮在粪池中的虫卵继续下沉。第三池：主要起储存粪液的作用。经前二格处理的粪液进入第三池，基本上已经不含寄生虫卵和病原微生物，达到了粪便无害化要求，可以供农田直接施肥。
清理化粪池就是给化粪池定期清理。化粪池（huàfènchí）是处理粪便并加以过滤沉淀的设备。其原理是固化物在池底分解，上层的水化物体，进入管道流走，防止了管道堵塞，给固化物体（粪便等垃圾）有充足的时间水解。 化粪池（septic tank）指的是将生活污水分格沉淀，及对污泥进行厌氧消化的小型处理构筑物。
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在清理化粪池过程中，要特别注意安 全问题。由于化粪池中可能存在有毒气体和可燃气体，因此要保持通风良好，并避免明火。在清理过程中，要注意不要将污水和污泥排放到周围的环境中，以免造成二次污染。应按照相关规定进行排放和处理。